کمبود طولانی‌مدت ویتامین B1 در بدن منجر به مرگ نورون‌ها و سایر سلول‌ها می‌شود و عملکرد بخش‌های مختلف مغز از جمله هیپوکامپ، ساختاری که مسئول شکل‌گیری خاطرات جدید است، به خطر می‌افتد.
بر اساس اخبار موجود در اینترنت، مغز به انرژی تولید شده توسط ویتامین B1 نیاز دارد تا به راحتی فکر کند و به خاطر بسپارد. کمبود شدید این ویتامین منجر به سندرم Wernicke-Korsakoff یا اختلال حافظه کوتاه مدت می شود. این اختلال بر سلامت مغز تأثیر می گذارد و علائمی شبیه به بیماری آلزایمر ایجاد می کند.
افرادی که از الکل سوء استفاده می کنند در معرض خطر بیشتری هستند. زیرا مصرف طولانی مدت الکل در جذب ویتامین ها توسط بدن اختلال ایجاد می کند. افرادی که جراحی بای پس معده انجام داده اند نیز در خطر ابتلا به این سندرم هستند.
مطالعات غیر انسانی نشان می دهد که سطوح پایین ویتامین B1 ممکن است منجر به تجمع پروتئین در مغز شود. این پروتئین ها پلاک ها و گره هایی را تشکیل می دهند که باعث مرگ سلول های مغز می شود. اتفاقات مشابه همزمان با پیشرفت بیماری آلزایمر رخ می دهد. بنابراین، محققان در حال بررسی هستند که آیا افزایش مصرف ویتامین B1 می تواند به پیشگیری یا کند کردن این دو بیماری مغزی کمک کند.